Proyecto
Development of a SSR Markers Set Associated with Berry size suitable for routine screening and early selection in table grape breeding programs, as a model for complex traits in Woody Species, N°1171378
| Rubro | Vid de mesa |
|---|---|
| Dependencia | La Platina - Santiago |
| Duración | Desde 01-01-2018 Hasta 31-03-2020 |
| Encargado (a) | Patricio Hinrichsen Ramirez |
Equipo de Trabajo
Objetivo General
Desarrollar un set de marcadores de tipo SSR (microsatélites) asociados con tamaño de baya, aplicables en selección rutinaria en etapas tempranas del mejoramiento genético de uva de mesa.
Objetivos Específicos
- Identificar marcadores SSR en regiones adyacentes a SNPs/InDels asociados a tamaño de baya, así como en las cercanías de genes previamente asociados al carácter, tales como VvCEB1, VvNAC26 y otros, descritos mediante análisis transcriptómicos.
- Evaluar la naturaleza multi-alélica de los SSRs identificados usando un panel de variedades de uva de mesa (5-10).
- Analizar las asociaciones fenotipo-genotipo entre los alelos de SSRs y y el tamaño de baya mediante fenotipado y genotipado de poblaciones segregantes y variedades caracterizadas para tamaño de baya (colección de variedades y panel nuclear de vid).
- Comparar la utilidad y costos del uso de los marcadores SNPs/InDels vs. SSRs para tamaño de baya, en el contexto del PMG de uva de mesa de INIA.
Publicaciones
- Muñoz-Espinoza, C., Di Genova, A., Sánchez, A., Correa, J., Espinoza, A., Meneses, C., Maass, A., Orellana, A. & Hinrichsen, P. 2020. Identification of SNPs and InDels associated with berry size in table grapes integrating genetic and transcriptomic approaches. BMC Plant Biol. 20:365. doi.org/10.1186/s12870-020-02564-4 (2020)
Presentaciones en Congresos
- Hinrichsen, P. Grapevine genetics at INIA-Chile: From genetic diversity to breeding applications. XII Reunión Soc. Biología Vegetal. 4-7 diciembre, 2017. Villarrica (2018)
- Muñoz-Espinoza, E., Correa, J., Burgos, M., Lacombe, T., Laucou, V., Péros, J.P. & Hinrichsen, P. Towards the Development of a Selection Panel for Berry Size in Table Grapes Based on the Use of SNP and Indel Markers. XXVI Plant & Animal Genome Meeting. 13-17 de enero, 2018. San Diego, CA. (2018)
- Burgos, M., Jiménez, P., Bustos, S., Muñoz-Espinoza, C., & Hinrichsen, P. Search os SSRs associated to berry weight in table grapes. XII international Conference on Grapevine Breeding and Genetics. Bordeaux, Francia. Julio 15-19, 2018. (2018)
- Muñoz-Espinoza, C., Correa, J., Burgos, M., Lacombe, T., Laucou, V., Péros, J.-P. & Hinrichsen, P. Discovery and validation of SNP and InDel markers associated to berry size. XII international Conference on Grapevine Breeding and Genetics. Bordeaux, Francia. Julio 15-19, 2018. (2018)
- Burgos, M., Jiménez, P., Bustos, S., Muñoz-Espinoza, C. & Hinrichsen, P. Extending the search for berry size selection markers in table grape (Vitis vinifera L.): New SSRs derived from SNP/INDELs and candidate genes. LI Reunión Anual Soc. de Genética de Chile. Puerto Varas, 20-22 de noviembre, 2018 (2018)
- Burgos, M., Meneses, M., Cona, M., Jiménez, P., Bustos, S., Castro, M.H., Salazar, E., Barba, P., Mejía, N., Muñoz-Espinoza, C. & Hinrichsen, P. 2020. Search for Markers Associated to Berry Size in Table Grape: New SSRs Derived from SNPs and InDels intended for marker assisted selection. O06. IX International Table Grape Symposium. Santiago, Chile. Enero 2020. (2020)