Proyecto

Equipo de Trabajo

Objetivo General

Desarrollar una plataforma en red con datos genómicos y herramientas de análisis para estudiar la variabilidad genética de las poblaciones de nematodos agalladores (Meloidogyne spp) y Pseudomonas syringae que afectan los frutales de Prunus en Chile, para facilitar el desarrollo de herramientas de identificación de variantes (y/o especies) que faciliten estudios epidemiológicos para su control.

Objetivos Específicos

• 1) Desarrollar capacidades de red (comunicación, análisis y respaldo de datos) para análisis bioinformáticos a través de la Red de Internet INIA, accesible para los investigadores del núcleo y todos los investigadores del INIA que requieren apoyo en el área genómica.
• 2) Determinar la variabilidad genética de las poblaciones de Pseudomonas syringae asociadas al cáncer bacterial en Prunus a nivel nacional, en función de polimorfismos de ADN, nivel de resistencia a Cu+2 y presencia de genes de resistencia a Cu+2
• 3) Establecer el nivel de similitud/disimilitud de Meloidogyne ethiopica con otros genomas del genero Meloidogyne secuenciados, para inferir sobre su posible origen e identificar marcadores moleculares (i.e. SSR) útiles para estudios poblacionales.
• 4) Desarrollar y validar herramientas moleculares de identificación de variantes genéticas asociados a patovares y/o especies, para P. syringae y Meloidogyne spp, respectivamente, para apoyar estudios epidemiológicos de control de estos patógeno y plaga, respectivamente.

Publicaciones

1. Beltrán, M.; Correa, F.; Millas, P.; Hinrichsen, P.; Donoso, J.; Abarca, P.; Meza, P.; Soto, S.; Bravo, R. y Sagredo, B. 2021. Ocurrencia de genes determinantes de resistencia al cobre en ensamblaje genómico y plasmidial en poblaciones de Pseudomona Syringae. Journal of Basic & Applied Genetics, Journal of Argentine Society of Genetics. Vol. XXXII Suppl. (1) 8-14 oct 2021, p. 110. DOI: 10.35407/bag.2021.32.01.suppl (2021)
2. Correa, F.; Meza, P.; Beltrán, M.; Millas, P.; Hinrichsen, P.; Donoso, J.; Abarca, P.; Soto, S.; Bravo, R. y Sagredo, B. 2021. Comparación de genomas del género Meloidogyne para el desarrollo de marcadores moleculares SSR útiles para estudios poblacionales. Journal of Basic & Applied Genetics, Journal of Argentine Society of Genetics. Vol. XXXII Suppl. (1) 8-14 oct 2021, p. 110. DOI: 10.35407/bag.2021.32.01.suppl (2021)
3. Beltrán, M. Francisca, Osorio, Valeria, Lemus, Gamalier, Millas, Paz, France, Andrés, Correa, Francisco, & Sagredo, Boris. (2021). Bacterial community associated with canker disease from sweet cherry orchards of central valley of Chile presents high resistance to copper. Chilean journal of agricultural research, 81(3), 378-389. https://dx.doi.org/10.4067/S0718-58392021000300378 (2021)

Presentaciones en Congresos

• Correa F, Beltrán F, Lemus G, Osorio V, Milla P, France A, Sagredo B (2019). Estudios genómicos para desarrollar pruebas HRM-qPCR para identificar y estudiar las poblaciones de Pseudomonas syringae agente causal del cáncer bacterial en cerezos. Encuentro Anual U-Genoma 23 julio 2019. Santiago. https://ugenoma.cl/2019/finaliza-exitosamente-encuentro-anual-u-genoma-2019/ (2019)
• Beltrán, M.F., F. Correa, P. Millas, P. Hinrichsen, J. Donoso, P. Abarca, P. Meza, S. Soto, R. Bravo and B. Sagredo, 2021. Ocurrencia de genes determinantes de resistencia al cobre en ensamble genómico y plasmidial en población de pseudomonas syringae pv. Syringae. BAG. Journal of Basic and Applied Genetics, XXXII(1 (suppl.)): 110. (2021)
• Beltrán, M.F., F. Correa, J. Otarola, P. Millas, R. Almada, A. Zamorano, N. Fiori, L. Pizarro, S. Pérez, C. Rubilar, M. Pinto and B. Sagredo, 2021. Genes del sistema t3ss en la población de pseudomonas syringae pv. Syringae asociado al cerezo (prunus avium l.) en chile. BAG. Journal of Basic and Applied Genetics, Vol XXXII(1 (suppl.)): 109. (2021)
• Correa, F., P. Meza, M.F. Beltrán, P. Millas, P. Hinrichsen, J. Donoso, P. Abarca, S. Soto, R. Bravo and B. Sagredo, 2021. Comparación de genomas del género meloidogyne para el desarrollo de marcadores moleculares ssr útiles para estudios poblacionales. BAG. Journal of Basic and Applied Genetics, XXXII(1 (suppl.)): 110. (2021)

Palabras Clave