Proyecto

Objetivo General

Identificar genes y proteínas involucrados en el desarrollo y crecimiento de la baya y su semilla en vides de mesa que sirvan al desarrollo de marcadores genéticos, en apoyo a programas de mejoramiento genético de la especie.

Objetivos Específicos

• Identificar genes de vid expresados diferencialmente durante el desarrollo de la baya y semilla en segregantes apirenos y semillados
• Evaluar respuesta de segregantes apirenos y semillados a tratamiento con GA3
• Identificar genes de vid expresados diferencialmente en respuesta al tratamiento con GA3
• Identificar péptidos de expresión diferencial en bayas de vid mediante análisis proteómico considerando distintos estados fenológicos
• Integración de la data mediante análisis bioinformático para contrastar y confirmar resultados de ambas aproximaciones
• Mapear genética y físicamente los genes identificados mediante genómica funcional y proteómica (alelos de genes candidatos)
• Identificar marcadores de tipo SNP en los genes candidatos que colocalicen con QTLs de los caracteres de interés y evaluar su correlación con fenotipos en diversos fondos genéticos

Presentaciones en Congresos

• Hinrichsen, P., González-Agüero, M., Pinto, M., Uquillas, C., Mejía, N., Riquelme, A., Fichet, T., Aravena, A., Almeida, A.M., Orellana, A. & Muñoz, C. Identification of table grapes genes related to seedlessness, berry size and GA-responsiveness by functional genomics. X International Conference on Grape Genetics and Breeding, O-22. Geneva, NY, EE.UU. 1-5 de agosto, 2010. (2010)
• Correa, J., Laborie, D., Casanueva, X., Mejía, N., Hinrichsen. P. & Pinto, M. Genetic characterization based on the best linear unbiased predictor (BLUP) of traits related to the cluster architecture of Vitis vinifera L. (P-1); X International Conference on Grape Genetics and Breeding. Geneva, NY, EE.UU. 1-5 de agosto, 2010. (2010)
• Paul, R., Jego, M., Muñoz, C., Almeida, A. M., Hinrichsen, P. & Orellana, A. Grape berry development proteome: protein extraction and resolution by two-dimensional gel electrophoresis. (P-31); X International Conference on Grape Genetics and Breeding. Geneva, NY, EE.UU. 1-5 de agosto, 2010 (2010)
• C. Muñoz, A. Di Genova, A. Maass, A. Orellana, P. Hinrichsen & A. Aravena. Vitis vinifera genome annotation improvement using next-generation sequencing technologies & NCBI public data. (P-32); X International Conference on Grape Genetics and Breeding. Geneva, NY, EE.UU. 1-5 de agosto, 2010. (2010)
• González-Agüero, M., Muñoz-Robredo, P., Gudenschwager, O., Casanueva, X. and Hinrichsen, P. PMEI AND SPY: TWO GENES WITH POSIBLE ROLES IN SEED AND BERRY DEVELOPMENT IN TABLE GRAPE (Vitis vinifera L.). X International Conference on Grape Genetics and Breeding, O-22. Geneva, NY, EE.UU. 1-5 de agosto, 2010. (2010)
• Hinrichsen, P. Desarrollo de una plataforma de genómica funcional como apoyo al fitomejoramiento de uva de mesa. XIV Congreso Latinoamericano de Genética, ALAG-2010. Viña del Mar, Octubre 1-5, 2010. (2010)
• Correa, J., Laborie, D., Casanueva, X., Mejía, N., Hinrichsen, P. and. Pinto, M.,CARACTERIZACIÓN GENÉTICA DE RASGOS ASOCIADOS A LA ESTRUCTURA DE RACIMO EN UVA DE MESA BASADO EN EL MEJOR PREDICTOR LINEAL INSESGADO, BLUP. XIV Congreso Latinoamericano de Genética (ALAG 2010). Viña del Mar, Noviembre 1-5, 2010. (2010)
• Muñoz, C., Di Genova, A., Maass, A., Orellana, A., Hinrichsen, P., y Aravena, A. MEJORAMIENTO DE LA ANOTACIÓN DEL GENOMA DE Vitis vinifera USANDO NUEVAS TECNOLOGÍAS DE SECUENCIAMIENTO Y DATOS PÚBLICOS DE NCBI. XIV Congreso Latinoamericano de Genética, ALAG-2010. Viña del Mar, Octubre 1-5, 2010 (2010)
• Hinrichsen, P. Grapevine, the first fruit crop sequenced. Taller y Simposio Internacional "Genómica de Plantas: Aplicaciones al Mejoramiento Genético". Santiago, 7-8 de junio, 2011. (2011)
• González-Agüero, M., García-Rojas, M., Muñoz, C., Di Genova, A., Maass, A., Orellana, A., Hinrichsen, P. 2011. BÚSQUEDA DE GENES RELACIONADOS CON EL DESARROLLO DE LA BAYA EN UVA DE MESA (V. VINIFERA) MEDIANTE SECUENCIACIÓN MASIVA DE CDNAS (RNA-SEQ). 62º Congreso Agronómico de Chile, 26-28 de Octubre de 2011. Iquique, Chile. (2011)
• García-Rojas, M., Hinrichsen, P., González-Agüero, M. 2011. IDENTIFICATION AND CHARACTERIZATION OF GENES RELATED TO EMBRYO DEVELOPMENT IN TABLE GRAPE (Vitis vinifera L.). VI Reunión de Biología Vegetal, 30 de Noviembre al 2 de Diciembre. Pucón, Chile. (2011)
• Muñoz, C., Di Genova, A., Maass, A., González-Agüero, M., Orellana, A., Hinrichsen, P. ADVANCES IN THE IDENTIFICATION OF PUTATIVE BIOMARKERS ASSOCIATED TO BERRY SIZE TRAIT IN TABLE GRAPES, USING A MASSIVE TRANSCRIPTOMIC APPROACH (RNA-SEQ). VI Reunión de Biología Vegetal, 30 de Noviembre al 2 de Diciembre. Pucón, Chile. (2011)
• Correa, J., Laborie, D., Mamani, M., Muñoz, C., Pinto, M & Hinrichsen, P. 2011. Genetic characterization of the cluster structure of grapevine. VI Reunión de Biología Vegetal. 30 nov- 2 dic, 2011. Pucón, Chile. (2011)
• Valdés, C., Olivares, D., Correa, J., Laborie, D., Silva, H., Hinrichsen, P. & Pinto, M. 2011. Relationship between the size of berries and the sugar content in contrasting phenotypes of grapevine (Vitis vinifera L.). VI Reunión de Biología Vegetal. 30 nov- 2 dic, 2011. Pucón, Chile. (2011)
• Muñoz, C., Di Genova, A., Maass, A., González-Agüero, M., Orellana, A. & Hinrichsen, P. 2011. Advances in the identification of putative biomarkers associated to berry size trait in table grape using a massive transcriptomic approach (RNA-Seq). VI Reunión de Biología Vegetal. 30 nov- 2 dic, 2011. Pucón, Chile. (2011)
• Ravest, G., Silva, S., Di Genova, A., Muñoz, C., Maas, A., Pinto, M & Hinrichsen, P. 2011. Expression analysis of the gibberellin metabolic pathway using massive RNA-Seq on distinct phenotypes of a sibling population of seedless table grapes. VI Reunión de Biología Vegetal. 30 nov- 2 dic, 2011. Pucón, Chile. (2011)
• Correa, J., Valdés, C., Laborie, D., Mamani, M., Pinto, M. & Hinrichsen, P. 2011. Genetic determinism of sugar content in table grape berries. VI Reunión de Biología Vegetal. 30 nov- 2 dic, 2011. Pucón, Chile. (2011)
• Correa, J., Laborie, D., Mamani, M., Pinto, M. Muñoz, C. & Hinrichsen, P. 2011. QTL for gibberellic acid (GA3) response of berry size in table grape (Vitis vinifera L.). VI Reunión de Biología Vegetal. 30 nov- 2 dic, 2011. Pucón, Chile. (2011)

Palabras Clave